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Common cancers develop through a multistep process often including inherited susceptibility. Collaboration among multiple institutions, and funding from multiple sources, has allowed the development of an inexpensive genotyping microarray, the OncoArray. The array includes a genome-wide backbone, comprising 230,000 SNPs tagging most common genetic variants, together with dense mapping of known susceptibility regions, rare variants from sequencing experiments, pharmacogenetic markers and cancer related traits.
The OncoArray Consortium: a network for understanding the genetic architecture of common cancers / Amos, C.I., Dennis, J., Wang, Z., Byun, J., Schumacher, F.R., Gayther, S.A., Casey, G., Hunter, D.J., Sellers, T.A., Gruber, S.B., Dunning, A.M., Michailidou, K., Fachal, L., Doheny, K., Spurdle, A.B., Li, Y., Xiao, X., Romm, J., Pugh, E., Coetzee, G.A., et al.. - In: CANCER EPIDEMIOLOGY BIOMARKERS & PREVENTION. - ISSN 1055-9965. - (2016). [10.1158/1055-9965.EPI-16-0106]
The OncoArray Consortium: a network for understanding the genetic architecture of common cancers
Amos, Christopher I;Dennis, Joe;Wang, Zhaoming;Byun, Jinyoung;Schumacher, Fredrick R;Gayther, Simon A;Casey, Graham;Hunter, David J;Sellers, Thomas A;Gruber, Stephen B;Dunning, Alison M;Michailidou, Kyriaki;Fachal, Laura;Doheny, Kimberly;Spurdle, Amanda B;Li, Yafang;Xiao, Xiangjun;Romm, Jane;Pugh, Elizabeth;Coetzee, Gerhard A;Hazelett, Dennis J;Bojesen, Stig E;Caga Anan, Charlisse;Haiman, Christopher A;Kamal, Ahsan;Luccarini, Craig;Tessier, Daniel;Vincent, Daniel;Bacot, Francois;Van Den Berg, David J;Nelson, Stefanie;Demetriades, Stephen;Goldgar, David E;Couch, Fergus J;Forman, Judith L;Giles, Graham G;Conti, David V;Bickeböller, Heike;Risch, Angela;Waldenberger, Melanie;Brüske Hohlfeld, Irene;Hicks, Belynda D;Ling, Hua;Mcguffog, Lesley;Lee, Andrew;Kuchenbaecker, Karoline;Soucy, Penny;Manz, Judith;Cunningham, Julie M;Butterbach, Katja;Kote Jarai, Zsofia;Kraft, Peter;Fitzgerald, Liesel;Lindstrom, Sara;Adams, Marcia;Mckay, James D;Phelan, Catherine M;Benlloch, Sara;Kelemen, Linda E;Brennan, Paul;Riggan, Marjorie;O'Mara, Tracy A;Shen, Hongbing;Shi, Yong Yong;Thompson, Deborah J;Goodman, Marc T;Nielsen, Sune F;Berchuck, Andrew;Laboissiere, Sylvie;Schmit, Stephanie L;Shelford, Tameka;Edlund, Christopher K;Taylor, Jack A;Field, John Kirkpatrick;Park, Sue K;Offit, Kenneth;Thomassen, Mads;Schmutzler, Rita;OTTINI, LAURA;Hung, Rayjean J;Marchini, Jonathan;Amin Al Olama, Ali;Peters, Ulrike;Eeles, Rosalind A;Seldin, Michael F;Gillanders, Elizabeth;Seminara, Daniela;Antoniou, Antonis C;Pharoah, Paul D. P;Chenevix Trench, Georgia;Chanock, Stephen J;Simard, Jacques;Easton, Douglas F.
2016
Abstract
Common cancers develop through a multistep process often including inherited susceptibility. Collaboration among multiple institutions, and funding from multiple sources, has allowed the development of an inexpensive genotyping microarray, the OncoArray. The array includes a genome-wide backbone, comprising 230,000 SNPs tagging most common genetic variants, together with dense mapping of known susceptibility regions, rare variants from sequencing experiments, pharmacogenetic markers and cancer related traits.
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
