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We undertook a meta-analysis of six Crohn's disease genome-wide association studies (GWAS) comprising 6,333 affected individuals (cases) and 15,056 controls and followed up the top association signals in 15,694 cases, 14,026 controls and 414 parent-offspring trios. We identified 30 new susceptibility loci meeting genome-wide significance (P < 5 × 10⁻⁸). A series of in silico analyses highlighted particular genes within these loci and, together with manual curation, implicated functionally interesting candidate genes including SMAD3, ERAP2, IL10, IL2RA, TYK2, FUT2, DNMT3A, DENND1B, BACH2 and TAGAP. Combined with previously confirmed loci, these results identify 71 distinct loci with genome-wide significant evidence for association with Crohn's disease.
We undertook a meta-analysis of six Crohn's disease genome-wide association studies (GWAS) comprising 6,333 affected individuals (cases) and 15,056 controls and followed up the top association signals in 15,694 cases, 14,026 controls and 414 parent-offspring trios. We identified 30 new susceptibility loci meeting genome-wide significance (P < 5 × 10⁻⁸). A series of in silico analyses highlighted particular genes within these loci and, together with manual curation, implicated functionally interesting candidate genes including SMAD3, ERAP2, IL10, IL2RA, TYK2, FUT2, DNMT3A, DENND1B, BACH2 and TAGAP. Combined with previously confirmed loci, these results identify 71 distinct loci with genome-wide significant evidence for association with Crohn's disease.
Genome-wide meta-analysis increases to 71 the number of confirmed Crohn's disease susceptibility loci / Franke, Andre; Mcgovern, Dermot P. B.; Barrett, Jeffrey C.; Wang, Kai; Radford Smith, Graham L.; Ahmad, Tariq; Lees, Charlie W.; Balschun, Tobias; Lee, James; Roberts, Rebecca; Anderson, Carl A.; Bis, Joshua C.; Bumpstead, Suzanne; Ellinghaus, David; Festen, Eleonora M.; Georges, Michel; Green, Todd; Haritunians, Talin; Jostins, Luke; Latiano, Anna; Mathew, Christopher G.; Montgomery, Grant W.; Prescott, Natalie J.; Raychaudhuri, Soumya; Rotter, Jerome I.; Schumm, Philip; Sharma, Yashoda; Simms, Lisa A.; Taylor, Kent D.; Whiteman, David; Wijmenga, Cisca; Baldassano, Robert N.; Barclay, Murray; Bayless, Theodore M.; Brand, Stephan; Büning, Carsten; Cohen, Albert; Colombel, Jean Frederick; Cottone, Mario; Stronati, Laura; Denson, Ted; De Vos, Martine; D'Inca, Renata; Dubinsky, Marla; Edwards, Cathryn; Florin, Tim; Franchimont, Denis; Gearry, Richard; Glas, Jürgen; Van Gossum, Andre; Guthery, Stephen L.; Halfvarson, Jonas; Verspaget, Hein W.; Hugot, Jean Pierre; Karban, Amir; Laukens, Debby; Lawrance, Ian; Lemann, Marc; Levine, Arie; Libioulle, Cecile; Louis, Edouard; Mowat, Craig; Newman, William; Panés, Juliãn; Phillips, Anne; Proctor, Deborah D.; Regueiro, Miguel; Russell, Richard; Rutgeerts, Paul; Sanderson, Jeremy; Sans, Miquel; Seibold, Frank; Steinhart, A. Hillary; Stokkers, Pieter C. F.; Torkvist, Leif; Kullak Ublick, Gerd; Wilson, David; Walters, Thomas; Targan, Stephan R.; Brant, Steven R.; Rioux, John D.; D'Amato, Mauro; Weersma, Rinse K.; Kugathasan, Subra; Griffiths, Anne M.; Mansfield, John C.; Vermeire, Severine; Duerr, Richard H.; Silverberg, Mark S.; Satsangi, Jack; Schreiber, Stefan; Cho, Judy H.; Annese, Vito; Hakonarson, Hakon; Daly, Mark J.; Parkes, Miles. - In: NATURE GENETICS. - ISSN 1061-4036. - STAMPA. - 42:12(2010), pp. 1118-1125. [10.1038/ng.717]
Genome-wide meta-analysis increases to 71 the number of confirmed Crohn's disease susceptibility loci
Franke, Andre;Mcgovern, Dermot P. B.;Barrett, Jeffrey C.;Wang, Kai;Radford Smith, Graham L.;Ahmad, Tariq;Lees, Charlie W.;Balschun, Tobias;Lee, James;Roberts, Rebecca;Anderson, Carl A.;Bis, Joshua C.;Bumpstead, Suzanne;Ellinghaus, David;Festen, Eleonora M.;Georges, Michel;Green, Todd;Haritunians, Talin;Jostins, Luke;Latiano, Anna;Mathew, Christopher G.;Montgomery, Grant W.;Prescott, Natalie J.;Raychaudhuri, Soumya;Rotter, Jerome I.;Schumm, Philip;Sharma, Yashoda;Simms, Lisa A.;Taylor, Kent D.;Whiteman, David;Wijmenga, Cisca;Baldassano, Robert N.;Barclay, Murray;Bayless, Theodore M.;Brand, Stephan;Büning, Carsten;Cohen, Albert;Colombel, Jean Frederick;Cottone, Mario;STRONATI, LAURA;Denson, Ted;De Vos, Martine;D'Inca, Renata;Dubinsky, Marla;Edwards, Cathryn;Florin, Tim;Franchimont, Denis;Gearry, Richard;Glas, Jürgen;Van Gossum, Andre;Guthery, Stephen L.;Halfvarson, Jonas;Verspaget, Hein W.;Hugot, Jean Pierre;Karban, Amir;Laukens, Debby;Lawrance, Ian;Lemann, Marc;Levine, Arie;Libioulle, Cecile;Louis, Edouard;Mowat, Craig;Newman, William;Panés, Juliãn;Phillips, Anne;Proctor, Deborah D.;Regueiro, Miguel;Russell, Richard;Rutgeerts, Paul;Sanderson, Jeremy;Sans, Miquel;Seibold, Frank;Steinhart, A. Hillary;Stokkers, Pieter C. F.;Torkvist, Leif;Kullak Ublick, Gerd;Wilson, David;Walters, Thomas;Targan, Stephan R.;Brant, Steven R.;Rioux, John D.;D'Amato, Mauro;Weersma, Rinse K.;Kugathasan, Subra;Griffiths, Anne M.;Mansfield, John C.;Vermeire, Severine;Duerr, Richard H.;Silverberg, Mark S.;Satsangi, Jack;Schreiber, Stefan;Cho, Judy H.;Annese, Vito;Hakonarson, Hakon;Daly, Mark J.;Parkes, Miles
2010
Abstract
We undertook a meta-analysis of six Crohn's disease genome-wide association studies (GWAS) comprising 6,333 affected individuals (cases) and 15,056 controls and followed up the top association signals in 15,694 cases, 14,026 controls and 414 parent-offspring trios. We identified 30 new susceptibility loci meeting genome-wide significance (P < 5 × 10⁻⁸). A series of in silico analyses highlighted particular genes within these loci and, together with manual curation, implicated functionally interesting candidate genes including SMAD3, ERAP2, IL10, IL2RA, TYK2, FUT2, DNMT3A, DENND1B, BACH2 and TAGAP. Combined with previously confirmed loci, these results identify 71 distinct loci with genome-wide significant evidence for association with Crohn's disease.
We undertook a meta-analysis of six Crohn's disease genome-wide association studies (GWAS) comprising 6,333 affected individuals (cases) and 15,056 controls and followed up the top association signals in 15,694 cases, 14,026 controls and 414 parent-offspring trios. We identified 30 new susceptibility loci meeting genome-wide significance (P < 5 × 10⁻⁸). A series of in silico analyses highlighted particular genes within these loci and, together with manual curation, implicated functionally interesting candidate genes including SMAD3, ERAP2, IL10, IL2RA, TYK2, FUT2, DNMT3A, DENND1B, BACH2 and TAGAP. Combined with previously confirmed loci, these results identify 71 distinct loci with genome-wide significant evidence for association with Crohn's disease.
Computational Biology; Crohn Disease; Genetic Linkage; Genetic Loci; Genetic Variation; Genome, Human; Humans; Reproducibility of Results; Genetic Predisposition to Disease; Genome-Wide Association Study; Genetics
01 Pubblicazione su rivista::01a Articolo in rivista
Genome-wide meta-analysis increases to 71 the number of confirmed Crohn's disease susceptibility loci / Franke, Andre; Mcgovern, Dermot P. B.; Barrett, Jeffrey C.; Wang, Kai; Radford Smith, Graham L.; Ahmad, Tariq; Lees, Charlie W.; Balschun, Tobias; Lee, James; Roberts, Rebecca; Anderson, Carl A.; Bis, Joshua C.; Bumpstead, Suzanne; Ellinghaus, David; Festen, Eleonora M.; Georges, Michel; Green, Todd; Haritunians, Talin; Jostins, Luke; Latiano, Anna; Mathew, Christopher G.; Montgomery, Grant W.; Prescott, Natalie J.; Raychaudhuri, Soumya; Rotter, Jerome I.; Schumm, Philip; Sharma, Yashoda; Simms, Lisa A.; Taylor, Kent D.; Whiteman, David; Wijmenga, Cisca; Baldassano, Robert N.; Barclay, Murray; Bayless, Theodore M.; Brand, Stephan; Büning, Carsten; Cohen, Albert; Colombel, Jean Frederick; Cottone, Mario; Stronati, Laura; Denson, Ted; De Vos, Martine; D'Inca, Renata; Dubinsky, Marla; Edwards, Cathryn; Florin, Tim; Franchimont, Denis; Gearry, Richard; Glas, Jürgen; Van Gossum, Andre; Guthery, Stephen L.; Halfvarson, Jonas; Verspaget, Hein W.; Hugot, Jean Pierre; Karban, Amir; Laukens, Debby; Lawrance, Ian; Lemann, Marc; Levine, Arie; Libioulle, Cecile; Louis, Edouard; Mowat, Craig; Newman, William; Panés, Juliãn; Phillips, Anne; Proctor, Deborah D.; Regueiro, Miguel; Russell, Richard; Rutgeerts, Paul; Sanderson, Jeremy; Sans, Miquel; Seibold, Frank; Steinhart, A. Hillary; Stokkers, Pieter C. F.; Torkvist, Leif; Kullak Ublick, Gerd; Wilson, David; Walters, Thomas; Targan, Stephan R.; Brant, Steven R.; Rioux, John D.; D'Amato, Mauro; Weersma, Rinse K.; Kugathasan, Subra; Griffiths, Anne M.; Mansfield, John C.; Vermeire, Severine; Duerr, Richard H.; Silverberg, Mark S.; Satsangi, Jack; Schreiber, Stefan; Cho, Judy H.; Annese, Vito; Hakonarson, Hakon; Daly, Mark J.; Parkes, Miles. - In: NATURE GENETICS. - ISSN 1061-4036. - STAMPA. - 42:12(2010), pp. 1118-1125. [10.1038/ng.717]
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11573/840750
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
