In un precedente lavoro, abbiamo mappato due loci di suscettibilità (7q32 e 16p13) per la comparsa sull’EEG di una risposta fotoparossistica (PhotoParoxysmal Response = PPR) in 16 famiglie con epilessia mioclonica. Quattro geni candidati (SSTR5, CHRM2, CACNA1H, GRM8) sono stati selezionati in base alla loro posizione fisica, alla neuromodulazione delle dinamiche corticali e dei profili di espressione. Nel presente lavoro è stata valutata la rilevanza di questi geni candidati per la suscettibilità PPR, sottoponendo a screening due soggetti PPR di ogni famiglia (n = 32) e confrontandoli con individui di controllo CEPH per mutazioni nella codifica e regolazione di regioni conosciute, utilizzando la tecnica di sequenziamento diretto. Le varianti individuate sono state classificate in base al loro possibile impatto sulla regolazione genica, splicing, o sulla funzione delle proteine. Complementare allo screening di mutazione, le varianti sono state testate per la segregazione familiare e valutate in un studio di associazione caso-controllo. Risultati: abbiamo rilevato 39 varianti, 17 delle quali nuove (6 in SSTR5, 2 in CHRM2, 5 in CACNA1H e 4 in GRM8), 12 non trovate nei controlli e 3 situate in aree evolutive conservate (SSTR5: nt 384C> T, CHRM2: nt-153C> A, GRM8: c.1142T> A). Queste varianti hanno mostrato co-segregazione incompleta con PPR, ma con possibile significativa associazione tra PPR e c.1142T> A in 16 trios olandesi (p = 0,06) e 61 trios del Mediterraneo (Grecia, Italia, p = 0,02). Per valutare ulteriormente il ruolo della regione blocco c.1142T > A, abbiamo testato tre tag GRM8 SNPs (rs2109740, rs17685327, rs3808142) in uno studio caso-controllo multicentrico europeo in cinque coorti PPR provenienti dalla Germania (195 casi, 250 controlli), Portogallo (57 casi, 117 controlli), Grecia (40 casi / trios) e Italia (21 casi / trios).
Candidate gene analysis of GRM8, CHRM2, SSTR5 and CACNA1H in epilepsy-related photosensitivity / Pinto, D; KASTELEIJN NOLST TRENITE, D; Stephani, U; MARTINS DA SILVA, B; Covanis, T; Capovilla, G; Brinciotti, Mario; Verroti, A; Butinnelli, C; Rudolf, G; DE HAAN, G; DE KOVEL, C; Westland, B; Lindhout, D; Westland, B.. - In: EPILEPSIA. - ISSN 0013-9580. - STAMPA. - 48 (Suppl. 7):(2007), pp. 129-129. (Intervento presentato al convegno 27th International Epilepsy Congress tenutosi a Singapore nel JUL 08-12, 2007).
Candidate gene analysis of GRM8, CHRM2, SSTR5 and CACNA1H in epilepsy-related photosensitivity
BRINCIOTTI, Mario;
2007
Abstract
In un precedente lavoro, abbiamo mappato due loci di suscettibilità (7q32 e 16p13) per la comparsa sull’EEG di una risposta fotoparossistica (PhotoParoxysmal Response = PPR) in 16 famiglie con epilessia mioclonica. Quattro geni candidati (SSTR5, CHRM2, CACNA1H, GRM8) sono stati selezionati in base alla loro posizione fisica, alla neuromodulazione delle dinamiche corticali e dei profili di espressione. Nel presente lavoro è stata valutata la rilevanza di questi geni candidati per la suscettibilità PPR, sottoponendo a screening due soggetti PPR di ogni famiglia (n = 32) e confrontandoli con individui di controllo CEPH per mutazioni nella codifica e regolazione di regioni conosciute, utilizzando la tecnica di sequenziamento diretto. Le varianti individuate sono state classificate in base al loro possibile impatto sulla regolazione genica, splicing, o sulla funzione delle proteine. Complementare allo screening di mutazione, le varianti sono state testate per la segregazione familiare e valutate in un studio di associazione caso-controllo. Risultati: abbiamo rilevato 39 varianti, 17 delle quali nuove (6 in SSTR5, 2 in CHRM2, 5 in CACNA1H e 4 in GRM8), 12 non trovate nei controlli e 3 situate in aree evolutive conservate (SSTR5: nt 384C> T, CHRM2: nt-153C> A, GRM8: c.1142T> A). Queste varianti hanno mostrato co-segregazione incompleta con PPR, ma con possibile significativa associazione tra PPR e c.1142T> A in 16 trios olandesi (p = 0,06) e 61 trios del Mediterraneo (Grecia, Italia, p = 0,02). Per valutare ulteriormente il ruolo della regione blocco c.1142T > A, abbiamo testato tre tag GRM8 SNPs (rs2109740, rs17685327, rs3808142) in uno studio caso-controllo multicentrico europeo in cinque coorti PPR provenienti dalla Germania (195 casi, 250 controlli), Portogallo (57 casi, 117 controlli), Grecia (40 casi / trios) e Italia (21 casi / trios).I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.
