In un precedente lavoro, abbiamo mappato due loci di suscettibilità (7q32 e 16p13) per la comparsa sull’EEG di una risposta fotoparossistica (PhotoParoxysmal Response = PPR) in 16 famiglie con epilessia mioclonica. Quattro geni candidati (SSTR5, CHRM2, CACNA1H, GRM8) sono stati selezionati in base alla loro posizione fisica, alla neuromodulazione delle dinamiche corticali e dei profili di espressione. Nel presente lavoro è stata valutata la rilevanza di questi geni candidati per la suscettibilità PPR, sottoponendo a screening due soggetti PPR di ogni famiglia (n = 32) e confrontandoli con individui di controllo CEPH per mutazioni nella codifica e regolazione di regioni conosciute, utilizzando la tecnica di sequenziamento diretto. Le varianti individuate sono state classificate in base al loro possibile impatto sulla regolazione genica, splicing, o sulla funzione delle proteine. Complementare allo screening di mutazione, le varianti sono state testate per la segregazione familiare e valutate in un studio di associazione caso-controllo. Risultati: abbiamo rilevato 39 varianti, 17 delle quali nuove (6 in SSTR5, 2 in CHRM2, 5 in CACNA1H e 4 in GRM8), 12 non trovate nei controlli e 3 situate in aree evolutive conservate (SSTR5: nt 384C> T, CHRM2: nt-153C> A, GRM8: c.1142T> A). Queste varianti hanno mostrato co-segregazione incompleta con PPR, ma con possibile significativa associazione tra PPR e c.1142T> A in 16 trios olandesi (p = 0,06) e 61 trios del Mediterraneo (Grecia, Italia, p = 0,02). Per valutare ulteriormente il ruolo della regione blocco c.1142T > A, abbiamo testato tre tag GRM8 SNPs (rs2109740, rs17685327, rs3808142) in uno studio caso-controllo multicentrico europeo in cinque coorti PPR provenienti dalla Germania (195 casi, 250 controlli), Portogallo (57 casi, 117 controlli), Grecia (40 casi / trios) e Italia (21 casi / trios).
Candidate gene analysis of GRM8, CHRM2, SSTR5 and CACNA1H in epilepsy-related photosensitivity / Pinto, D., KASTELEIJN NOLST TRENITE, D., Stephani, U., MARTINS DA SILVA, B., Covanis, T., Capovilla, G., Brinciotti, M., Verroti, A., Butinnelli, C., Rudolf, G., DE HAAN, G., DE KOVEL, C., Westland, B., Lindhout, D., Westland, B.. - In: EPILEPSIA. - ISSN 0013-9580. - STAMPA. - 48 (Suppl. 7):(2007), pp. 129-129. (27th International Epilepsy Congress Singapore JUL 08-12, 2007).
Candidate gene analysis of GRM8, CHRM2, SSTR5 and CACNA1H in epilepsy-related photosensitivity
BRINCIOTTI, Mario;
2007
Abstract
In un precedente lavoro, abbiamo mappato due loci di suscettibilità (7q32 e 16p13) per la comparsa sull’EEG di una risposta fotoparossistica (PhotoParoxysmal Response = PPR) in 16 famiglie con epilessia mioclonica. Quattro geni candidati (SSTR5, CHRM2, CACNA1H, GRM8) sono stati selezionati in base alla loro posizione fisica, alla neuromodulazione delle dinamiche corticali e dei profili di espressione. Nel presente lavoro è stata valutata la rilevanza di questi geni candidati per la suscettibilità PPR, sottoponendo a screening due soggetti PPR di ogni famiglia (n = 32) e confrontandoli con individui di controllo CEPH per mutazioni nella codifica e regolazione di regioni conosciute, utilizzando la tecnica di sequenziamento diretto. Le varianti individuate sono state classificate in base al loro possibile impatto sulla regolazione genica, splicing, o sulla funzione delle proteine. Complementare allo screening di mutazione, le varianti sono state testate per la segregazione familiare e valutate in un studio di associazione caso-controllo. Risultati: abbiamo rilevato 39 varianti, 17 delle quali nuove (6 in SSTR5, 2 in CHRM2, 5 in CACNA1H e 4 in GRM8), 12 non trovate nei controlli e 3 situate in aree evolutive conservate (SSTR5: nt 384C> T, CHRM2: nt-153C> A, GRM8: c.1142T> A). Queste varianti hanno mostrato co-segregazione incompleta con PPR, ma con possibile significativa associazione tra PPR e c.1142T> A in 16 trios olandesi (p = 0,06) e 61 trios del Mediterraneo (Grecia, Italia, p = 0,02). Per valutare ulteriormente il ruolo della regione blocco c.1142T > A, abbiamo testato tre tag GRM8 SNPs (rs2109740, rs17685327, rs3808142) in uno studio caso-controllo multicentrico europeo in cinque coorti PPR provenienti dalla Germania (195 casi, 250 controlli), Portogallo (57 casi, 117 controlli), Grecia (40 casi / trios) e Italia (21 casi / trios).I documenti in IRIS sono protetti da copyright e tutti i diritti sono riservati, salvo diversa indicazione.
