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EnglishOn the basis of the molecular dynamics algorithm proposed by Kalibaeva et al. [G. Kalibaeva, M. Ferrario, G. Ciccotti, Mol. Phys. 101 (2003) 765.] for systems with holonomic constraints in isobaric-isothermal ensemble, we discuss a new recursive algorithm which eliminates the inconsistency associated with the double calculation of constraint forces present in RATTLE. The algorithm is tested on bulk water and on a system containing a polymer with a large number of constraints to evaluate the CPU gain with respect to the usual RATTLE algorithm. (c) 2006 Elsevier Inc. All rights reserved.
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| Titolo: | Trotter derived algorithms for molecular dynamics with constraints: Velocity Verlet revisited |
| Autori: | |
| Data di pubblicazione: | 2007 |
| Rivista: | |
| Handle: | http://hdl.handle.net/11573/33063 |
| Appartiene alla tipologia: | 01a Articolo in rivista |
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http://hdl.handle.net/11573/33063
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