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The contribution of histone-DNA interactions to nucleosome positioning in vivo is currently a matter of debate. We argue here that certain nucleosome positions, often in promoter regions, in yeast may be, at least in part, specified by the DNA sequence. In contrast other positions may be poorly specified. Positioning thus has both statistical and DNA-determined components. We further argue that the relative affinity of the octamer for different DNA sequences can vary and therefore the interaction of histones with the DNA is a 'tunable' property.
The DNA Sequence-dependence of Nucleosome Positioning in vivo and in vitro / A., Travers; E., Hiriart; M., Churcher; M., Caserta; DI MAURO, Ernesto. - In: JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. - ISSN 0739-1102. - STAMPA. - 27:6(2010), pp. 713-724. [10.1080/073911010010524942]
The DNA Sequence-dependence of Nucleosome Positioning in vivo and in vitro
The contribution of histone-DNA interactions to nucleosome positioning in vivo is currently a matter of debate. We argue here that certain nucleosome positions, often in promoter regions, in yeast may be, at least in part, specified by the DNA sequence. In contrast other positions may be poorly specified. Positioning thus has both statistical and DNA-determined components. We further argue that the relative affinity of the octamer for different DNA sequences can vary and therefore the interaction of histones with the DNA is a 'tunable' property.
01 Pubblicazione su rivista::01a Articolo in rivista
The DNA Sequence-dependence of Nucleosome Positioning in vivo and in vitro / A., Travers; E., Hiriart; M., Churcher; M., Caserta; DI MAURO, Ernesto. - In: JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS. - ISSN 0739-1102. - STAMPA. - 27:6(2010), pp. 713-724. [10.1080/073911010010524942]
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: https://hdl.handle.net/11573/28779
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
