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Hepatic, pancreatic, and biliary (HPB) organoids are powerful tools for studying development, disease, and regeneration. As organoid research expands, the need for clear definitions and nomenclature describing these systems also grows. To facilitate scientific communication and consistent interpretation, we revisit the concept of an organoid and introduce an intuitive classification system and nomenclature for describing these 3D structures through the consensus of experts in the field. To promote the standardization and validation of HPB organoids, we propose guidelines for establishing, characterizing, and benchmarking future systems. Finally, we address some of the major challenges to the clinical application of organoids.
Building consensus on definition and nomenclature of hepatic, pancreatic, and biliary organoids / Marsee, A.; Roos, F. J. M.; Verstegen, M. M. A.; Roos, F.; Verstegen, M.; Clevers, H.; Vallier, L.; Takebe, T.; Huch, M.; Peng, W. C.; Forbes, S.; Lemaigre, F.; de Koning, E.; Gehart, H.; van der Laan, L.; Spee, B.; Boj, S.; Baptista, P.; Schneeberger, K.; Soroka, C.; Heim, M.; Nuciforo, S.; Zaret, K.; Saito, Y.; Lutolf, M.; Cardinale, V.; Simons, B.; van IJzendoorn, S.; Kamiya, A.; Chikada, H.; Wang, S.; Mun, S. J.; Son, M. J.; Onder, T. T.; Boyer, J.; Sato, T.; Georgakopoulos, N.; Meneses, A.; Broutier, L.; Boulter, L.; Grun, D.; Ijzermans, J.; Artegiani, B.; van Boxtel, R.; Kuijk, E.; Carpino, G.; Peltz, G.; Banales, J.; Man, N.; Aloia, L.; Larusso, N.; George, G.; Rimland, C.; Yeoh, G.; Grappin-Botton, A.; Stange, D.; Prior, N.; Tirnitz-Parker, J. E. E.; Andersson, E.; Braconi, C.; Hannan, N.; Lu, W. -Y.; Strom, S.; Sancho-Bru, P.; Ogawa, S.; Corbo, V.; Lancaster, M.; Hu, H.; Fuchs, S.; Hendriks, D.; Forbes, S. J.; van der Laan, L. J. W.. - In: CELL STEM CELL. - ISSN 1934-5909. - 28:5(2021), pp. 816-832. [10.1016/j.stem.2021.04.005]
Building consensus on definition and nomenclature of hepatic, pancreatic, and biliary organoids
Marsee A.;Roos F. J. M.;Verstegen M. M. A.;Roos F.;Verstegen M.;Clevers H.;Vallier L.;Takebe T.;Huch M.;Peng W. C.;Forbes S.;Lemaigre F.;de Koning E.;Gehart H.;van der Laan L.;Spee B.;Boj S.;Baptista P.;Schneeberger K.;Soroka C.;Heim M.;Nuciforo S.;Zaret K.;Saito Y.;Lutolf M.;Cardinale V.;Simons B.;van IJzendoorn S.;Kamiya A.;Chikada H.;Wang S.;Mun S. J.;Son M. J.;Onder T. T.;Boyer J.;Sato T.;Georgakopoulos N.;Meneses A.;Broutier L.;Boulter L.;Grun D.;IJzermans J.;Artegiani B.;van Boxtel R.;Kuijk E.;Carpino G.;Peltz G.;Banales J.;Man N.;Aloia L.;LaRusso N.;George G.;Rimland C.;Yeoh G.;Grappin-Botton A.;Stange D.;Prior N.;Tirnitz-Parker J. E. E.;Andersson E.;Braconi C.;Hannan N.;Lu W. -Y.;Strom S.;Sancho-Bru P.;Ogawa S.;Corbo V.;Lancaster M.;Hu H.;Fuchs S.;Hendriks D.;Forbes S. J.;van der Laan L. J. W.
2021
Abstract
Hepatic, pancreatic, and biliary (HPB) organoids are powerful tools for studying development, disease, and regeneration. As organoid research expands, the need for clear definitions and nomenclature describing these systems also grows. To facilitate scientific communication and consistent interpretation, we revisit the concept of an organoid and introduce an intuitive classification system and nomenclature for describing these 3D structures through the consensus of experts in the field. To promote the standardization and validation of HPB organoids, we propose guidelines for establishing, characterizing, and benchmarking future systems. Finally, we address some of the major challenges to the clinical application of organoids.
01 Pubblicazione su rivista::01g Articolo di rassegna (Review)
Building consensus on definition and nomenclature of hepatic, pancreatic, and biliary organoids / Marsee, A.; Roos, F. J. M.; Verstegen, M. M. A.; Roos, F.; Verstegen, M.; Clevers, H.; Vallier, L.; Takebe, T.; Huch, M.; Peng, W. C.; Forbes, S.; Lemaigre, F.; de Koning, E.; Gehart, H.; van der Laan, L.; Spee, B.; Boj, S.; Baptista, P.; Schneeberger, K.; Soroka, C.; Heim, M.; Nuciforo, S.; Zaret, K.; Saito, Y.; Lutolf, M.; Cardinale, V.; Simons, B.; van IJzendoorn, S.; Kamiya, A.; Chikada, H.; Wang, S.; Mun, S. J.; Son, M. J.; Onder, T. T.; Boyer, J.; Sato, T.; Georgakopoulos, N.; Meneses, A.; Broutier, L.; Boulter, L.; Grun, D.; Ijzermans, J.; Artegiani, B.; van Boxtel, R.; Kuijk, E.; Carpino, G.; Peltz, G.; Banales, J.; Man, N.; Aloia, L.; Larusso, N.; George, G.; Rimland, C.; Yeoh, G.; Grappin-Botton, A.; Stange, D.; Prior, N.; Tirnitz-Parker, J. E. E.; Andersson, E.; Braconi, C.; Hannan, N.; Lu, W. -Y.; Strom, S.; Sancho-Bru, P.; Ogawa, S.; Corbo, V.; Lancaster, M.; Hu, H.; Fuchs, S.; Hendriks, D.; Forbes, S. J.; van der Laan, L. J. W.. - In: CELL STEM CELL. - ISSN 1934-5909. - 28:5(2021), pp. 816-832. [10.1016/j.stem.2021.04.005]
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
