PETRIZZELLI, FRANCESCO
PETRIZZELLI, FRANCESCO
DIPARTIMENTO DI MEDICINA SPERIMENTALE
A comparative benchmark of classic DNA motif discovery tools on synthetic data
2021 Castellana, S.; Biagini, T.; Parca, L.; Petrizzelli, F.; Bianco, S. D.; Vescovi, A. L.; Carella, M.; Mazza, T.
APOGEE 2: multi-layer machine-learning model for the interpretable prediction of mitochondrial missense variants
2023 Bianco, S. D.; Parca, L.; Petrizzelli, F.; Biagini, T.; Giovannetti, A.; Liorni, N.; Napoli, A.; Carella, M.; Procaccio, V.; Lott, M. T.; Zhang, S.; Vescovi, A. L.; Wallace, D. C.; Caputo, V.; Mazza, T.
Are gaming-enabled graphic processing unit cards convenient for molecular dynamics simulation?
2019 Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Truglio, Mauro; Cespa, Roberto; Barbieri, Alessandro; Capocefalo, Daniele; Castellana, Stefano; Tevy, Maria Florencia; Carella, Massimo; Mazza, Tommaso
Clinical and molecular description of the first Italian cohort of 33 subjects with hypophosphatasia
2023 Cinque, L.; Pugliese, F.; Salcuni, A. S.; Trombetta, D.; Battista, C.; Biagini, T.; Augello, B.; Nardella, G.; Conti, F.; Corbetta, S.; Fischetto, R.; Foiadelli, T.; Gaudio, A.; Giannini, C.; Grosso, E.; Guabello, G.; Massuras, S.; Palermo, A.; Politano, L.; Pigliaru, F.; Ruggeri, R. M.; Scarano, E.; Vicchio, P.; Cannavo, S.; Celli, M.; Petrizzelli, F.; Mastroianno, M.; Castori, M.; Scillitani, A.; Guarnieri, V.
Clinical variability in DYNC2H1-related skeletal ciliopathies includes Ellis-van Creveld syndrome
2023 Piceci-Sparascio, Francesca; Micale, Lucia; Torres, Barbara; Guida, Valentina; Consoli, Federica; Torrente, Isabella; Onori, Annamaria; Frustaci, Emanuela; D'Asdia, Maria Cecilia; Petrizzelli, Francesco; Bernardini, Laura; Mancini, Cecilia; Soli, Fiorenza; Cocciadiferro, Dario; Guadagnolo, Daniele; Mastromoro, Gioia; Putotto, Carolina; Fontana, Franco; Brunetti-Pierri, Nicola; Novelli, Antonio; Pizzuti, Antonio; Marino, Bruno; Digilio, Maria Cristina; Mazza, Tommaso; Dallapiccola, Bruno; Ruiz-Perez, Victor Luis; Tartaglia, Marco; Castori, Marco; De Luca, Alessandro
Connecting the dots: A practical evaluation of web-tools for describing protein dynamics as networks
2022 Petrizzelli, Francesco; Biagini, Tommaso; Bianco, SALVATORE DANIELE; Liorni, Niccolo'; Napoli, Alessandro; Castellana, Stefano; Mazza, Tommaso
Exploiting in silico structural analysis to introduce emerging genotype–phenotype correlations in DHCR24-related sterol biosynthesis disorder: a case study
2024 Cocciadiferro, Dario; Mazza, Tommaso; Vecchio, Davide; Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Agolini, Emanuele; Villani, Andrea; Minervino, Daniele; Martinelli, Diego; Rizzo, Cristiano; Boenzi, Sara; Panfili, FILIPPO MARIA; Sabrina Buonuomo, Paola; Macchiaiolo, Marina; Bartuli and Antonio Novelli, Andrea
GDF5 mutation case report and a systematic review of molecular and clinical spectrum: Expanding current knowledge on genotype-phenotype correlations
2021 Genovesi, M. L.; Guadagnolo, D.; Marchionni, E.; Giovannetti, A.; Traversa, A.; Panzironi, N.; Bernardo, S.; Palumbo, P.; Petrizzelli, F.; Carella, M.; Mazza, T.; Pizzuti, A.; Caputo, V.
Heterozygosity for loss-of-function variants in LZTR1 is associated with isolated multiple café-au-lait macules
2024 Mastromoro, Gioia; Santoro, Claudia; Motta, Marialetizia; Sorrentino, Ugo; Daniele, Paola; Peduto, Cristina; Petrizzelli, Francesco; Tripodi, Martina; Pinna, Valentina; Zanobio, Mariateresa; Rotundo, Giovannina; Bellacchio, Emanuele; Lepri, Francesca; Farina, Antonella; D'Asdia, Maria Cecilia; Piceci-Sparascio, Francesca; Biagini, Tommaso; Petracca, Antonio; Castori, Marco; Melis, Daniela; Accadia, Maria; Traficante, Giovanna; Tarani, Luigi; Fontana, Paolo; Sirchia, Fabio; Paparella, Roberto; Currò, Aurora; Benedicenti, Francesco; Scala, Iris; Dentici, MARIA LISA; Leoni, Chiara; Trevisan, Valentina; Cecconi, Antonella; Giustini, Sandra; Pizzuti, Antonio; Salviati, Leonardo; Novelli, Antonio; Zampino, Giuseppe; Zenker, Martin; Genuardi, Maurizio; Cristina Digilio, Maria; Papi, Laura; Perrotta, Silverio; Nigro, Vincenzo; Castellanos, Elisabeth; Mazza, Tommaso; Trevisson, Eva; Tartaglia, Marco; Piluso, Giulio; De Luca, Alessandro
Heterozygous nonsense ARX mutation in a family highlights the complexity of clinical and molecular diagnosis in case of chromosomal and single gene disorder co-inheritance
2020 Traversa, Alice; Marchionni, Enrica; Giovannetti, Agnese; Genovesi, Maria L; Panzironi, Noemi; Margiotti, Katia; Napoli, Giulia; Piceci Sparascio, Francesca; De Luca, Alessandro; Petrizzelli, Francesco; Carella, Massimo; Cardona, Francesco; Bernardo, Silvia; Manganaro, Lucia; Mazza, Tommaso; Pizzuti, Antonio; Caputo, Viviana
Investigating Mitochondrial Gene Expression Patterns in Drosophila melanogaster Using Network Analysis to Understand Aging Mechanisms
2023 Mangoni, M.; Petrizzelli, F.; Liorni, N.; Bianco, S. D.; Biagini, T.; Napoli, A.; Adinolfi, M.; Guzzi, P. H.; Novelli, A.; Caputo, V.; Mazza, T.
KDM6A missense variants hamper H3 histone demethylation in lung squamous cell carcinoma
2022 Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Bianco, SALVATORE DANIELE; Liorni, Niccolo'; Napoli, Alessandro; Castellana, Stefano; Luigi Vescovi, Angelo; Carella, Massimo; Caputo, Viviana; Mazza, Tommaso
Mechanisms of pathogenesis of missense mutations on the KDM6A-H3 interaction in type 2 Kabuki Syndrome
2020 Petrizzelli, F.; Biagini, T.; Barbieri, A.; Parca, L.; Panzironi, N.; Castellana, S.; Caputo, V.; Vescovi, A. L.; Carella, M.; Mazza, T.
MitImpact 3: modeling the residue interaction network of the Respiratory Chain subunits
2021 Castellana, S.; Biagini, T.; Petrizzelli, F.; Parca, L.; Panzironi, N.; Caputo, V.; Vescovi, A. L.; Carella, M.; Mazza, T.
Molecular dynamics analysis of superoxide dismutase 1 mutations suggests decoupling between mechanisms underlying ALS onset and progression
2023 Kalia, Munishikha; Miotto, Mattia; Ness, Deborah; Opie-Martin, Sarah; Spargo, Thomas P.; DI RIENZO, Lorenzo; Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Al Khleifat, Ahmad; Kabiljo, Renata; Mazza, Tommaso; Ruocco, Giancarlo; Milanetti, Edoardo; JB Dobson, Richard; Al-Chalabi, Ammar; Iacoangeli, Alfredo
Phosphorylation within intrinsic disordered region discriminates histone variant macroh2a1 splicing isoforms-macroh2a1.1 and macroh2a1.2
2021 Giallongo, S.; Lo Re, O.; Lochmanova, G.; Parca, L.; Petrizzelli, F.; Zdrahal, Z.; Mazza, T.; Vinciguerra, M.
Potassium Channel {KCNH}1 Activating Variants Cause Altered Functional and Morphological Ciliogenesis
2022 Napoli, Giulia; Panzironi, Noemi; Traversa, Alice; Catalanotto, Caterina; Pace, Valentina; Petrizzelli, Francesco; Giovannetti, Agnese; Lazzari, Sara; Cogoni, Carlo; Tartaglia, Marco; Carella, Massimo; Mazza, Tommaso; Pizzuti, Antonio; Parisi, Chiara; Caputo, Viviana
Pyntacle: a parallel computing-enabled framework for large-scale network biology analysis
2020 Parca, L.; Truglio, M.; Biagini, T.; Castellana, S.; Petrizzelli, F.; Capocefalo, D.; Jordan, F.; Carella, M.; Mazza, T.
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| A comparative benchmark of classic DNA motif discovery tools on synthetic data | 2021 | Castellana, S.; Biagini, T.; Parca, L.; Petrizzelli, F.; Bianco, S. D.; Vescovi, A. L.; Carella, M.; Mazza, T. | |
| APOGEE 2: multi-layer machine-learning model for the interpretable prediction of mitochondrial missense variants | 2023 | Bianco, S. D.; Parca, L.; Petrizzelli, F.; Biagini, T.; Giovannetti, A.; Liorni, N.; Napoli, A.; Carella, M.; Procaccio, V.; Lott, M. T.; Zhang, S.; Vescovi, A. L.; Wallace, D. C.; Caputo, V.; Mazza, T. | |
| Are gaming-enabled graphic processing unit cards convenient for molecular dynamics simulation? | 2019 | Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Truglio, Mauro; Cespa, Roberto; Barbieri, Alessandro; Capocefalo, Daniele; Castellana, Stefano; Tevy, Maria Florencia; Carella, Massimo; Mazza, Tommaso | |
| Clinical and molecular description of the first Italian cohort of 33 subjects with hypophosphatasia | 2023 | Cinque, L.; Pugliese, F.; Salcuni, A. S.; Trombetta, D.; Battista, C.; Biagini, T.; Augello, B.; Nardella, G.; Conti, F.; Corbetta, S.; Fischetto, R.; Foiadelli, T.; Gaudio, A.; Giannini, C.; Grosso, E.; Guabello, G.; Massuras, S.; Palermo, A.; Politano, L.; Pigliaru, F.; Ruggeri, R. M.; Scarano, E.; Vicchio, P.; Cannavo, S.; Celli, M.; Petrizzelli, F.; Mastroianno, M.; Castori, M.; Scillitani, A.; Guarnieri, V. | |
| Clinical variability in DYNC2H1-related skeletal ciliopathies includes Ellis-van Creveld syndrome | 2023 | Piceci-Sparascio, Francesca; Micale, Lucia; Torres, Barbara; Guida, Valentina; Consoli, Federica; Torrente, Isabella; Onori, Annamaria; Frustaci, Emanuela; D'Asdia, Maria Cecilia; Petrizzelli, Francesco; Bernardini, Laura; Mancini, Cecilia; Soli, Fiorenza; Cocciadiferro, Dario; Guadagnolo, Daniele; Mastromoro, Gioia; Putotto, Carolina; Fontana, Franco; Brunetti-Pierri, Nicola; Novelli, Antonio; Pizzuti, Antonio; Marino, Bruno; Digilio, Maria Cristina; Mazza, Tommaso; Dallapiccola, Bruno; Ruiz-Perez, Victor Luis; Tartaglia, Marco; Castori, Marco; De Luca, Alessandro | |
| Connecting the dots: A practical evaluation of web-tools for describing protein dynamics as networks | 2022 | Petrizzelli, Francesco; Biagini, Tommaso; Bianco, SALVATORE DANIELE; Liorni, Niccolo'; Napoli, Alessandro; Castellana, Stefano; Mazza, Tommaso | |
| Exploiting in silico structural analysis to introduce emerging genotype–phenotype correlations in DHCR24-related sterol biosynthesis disorder: a case study | 2024 | Cocciadiferro, Dario; Mazza, Tommaso; Vecchio, Davide; Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Agolini, Emanuele; Villani, Andrea; Minervino, Daniele; Martinelli, Diego; Rizzo, Cristiano; Boenzi, Sara; Panfili, FILIPPO MARIA; Sabrina Buonuomo, Paola; Macchiaiolo, Marina; Bartuli and Antonio Novelli, Andrea | |
| GDF5 mutation case report and a systematic review of molecular and clinical spectrum: Expanding current knowledge on genotype-phenotype correlations | 2021 | Genovesi, M. L.; Guadagnolo, D.; Marchionni, E.; Giovannetti, A.; Traversa, A.; Panzironi, N.; Bernardo, S.; Palumbo, P.; Petrizzelli, F.; Carella, M.; Mazza, T.; Pizzuti, A.; Caputo, V. | |
| Heterozygosity for loss-of-function variants in LZTR1 is associated with isolated multiple café-au-lait macules | 2024 | Mastromoro, Gioia; Santoro, Claudia; Motta, Marialetizia; Sorrentino, Ugo; Daniele, Paola; Peduto, Cristina; Petrizzelli, Francesco; Tripodi, Martina; Pinna, Valentina; Zanobio, Mariateresa; Rotundo, Giovannina; Bellacchio, Emanuele; Lepri, Francesca; Farina, Antonella; D'Asdia, Maria Cecilia; Piceci-Sparascio, Francesca; Biagini, Tommaso; Petracca, Antonio; Castori, Marco; Melis, Daniela; Accadia, Maria; Traficante, Giovanna; Tarani, Luigi; Fontana, Paolo; Sirchia, Fabio; Paparella, Roberto; Currò, Aurora; Benedicenti, Francesco; Scala, Iris; Dentici, MARIA LISA; Leoni, Chiara; Trevisan, Valentina; Cecconi, Antonella; Giustini, Sandra; Pizzuti, Antonio; Salviati, Leonardo; Novelli, Antonio; Zampino, Giuseppe; Zenker, Martin; Genuardi, Maurizio; Cristina Digilio, Maria; Papi, Laura; Perrotta, Silverio; Nigro, Vincenzo; Castellanos, Elisabeth; Mazza, Tommaso; Trevisson, Eva; Tartaglia, Marco; Piluso, Giulio; De Luca, Alessandro | |
| Heterozygous nonsense ARX mutation in a family highlights the complexity of clinical and molecular diagnosis in case of chromosomal and single gene disorder co-inheritance | 2020 | Traversa, Alice; Marchionni, Enrica; Giovannetti, Agnese; Genovesi, Maria L; Panzironi, Noemi; Margiotti, Katia; Napoli, Giulia; Piceci Sparascio, Francesca; De Luca, Alessandro; Petrizzelli, Francesco; Carella, Massimo; Cardona, Francesco; Bernardo, Silvia; Manganaro, Lucia; Mazza, Tommaso; Pizzuti, Antonio; Caputo, Viviana | |
| Investigating Mitochondrial Gene Expression Patterns in Drosophila melanogaster Using Network Analysis to Understand Aging Mechanisms | 2023 | Mangoni, M.; Petrizzelli, F.; Liorni, N.; Bianco, S. D.; Biagini, T.; Napoli, A.; Adinolfi, M.; Guzzi, P. H.; Novelli, A.; Caputo, V.; Mazza, T. | |
| KDM6A missense variants hamper H3 histone demethylation in lung squamous cell carcinoma | 2022 | Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Bianco, SALVATORE DANIELE; Liorni, Niccolo'; Napoli, Alessandro; Castellana, Stefano; Luigi Vescovi, Angelo; Carella, Massimo; Caputo, Viviana; Mazza, Tommaso | |
| Mechanisms of pathogenesis of missense mutations on the KDM6A-H3 interaction in type 2 Kabuki Syndrome | 2020 | Petrizzelli, F.; Biagini, T.; Barbieri, A.; Parca, L.; Panzironi, N.; Castellana, S.; Caputo, V.; Vescovi, A. L.; Carella, M.; Mazza, T. | |
| MitImpact 3: modeling the residue interaction network of the Respiratory Chain subunits | 2021 | Castellana, S.; Biagini, T.; Petrizzelli, F.; Parca, L.; Panzironi, N.; Caputo, V.; Vescovi, A. L.; Carella, M.; Mazza, T. | |
| Molecular dynamics analysis of superoxide dismutase 1 mutations suggests decoupling between mechanisms underlying ALS onset and progression | 2023 | Kalia, Munishikha; Miotto, Mattia; Ness, Deborah; Opie-Martin, Sarah; Spargo, Thomas P.; DI RIENZO, Lorenzo; Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Al Khleifat, Ahmad; Kabiljo, Renata; Mazza, Tommaso; Ruocco, Giancarlo; Milanetti, Edoardo; JB Dobson, Richard; Al-Chalabi, Ammar; Iacoangeli, Alfredo | |
| Phosphorylation within intrinsic disordered region discriminates histone variant macroh2a1 splicing isoforms-macroh2a1.1 and macroh2a1.2 | 2021 | Giallongo, S.; Lo Re, O.; Lochmanova, G.; Parca, L.; Petrizzelli, F.; Zdrahal, Z.; Mazza, T.; Vinciguerra, M. | |
| Potassium Channel {KCNH}1 Activating Variants Cause Altered Functional and Morphological Ciliogenesis | 2022 | Napoli, Giulia; Panzironi, Noemi; Traversa, Alice; Catalanotto, Caterina; Pace, Valentina; Petrizzelli, Francesco; Giovannetti, Agnese; Lazzari, Sara; Cogoni, Carlo; Tartaglia, Marco; Carella, Massimo; Mazza, Tommaso; Pizzuti, Antonio; Parisi, Chiara; Caputo, Viviana | |
| Pyntacle: a parallel computing-enabled framework for large-scale network biology analysis | 2020 | Parca, L.; Truglio, M.; Biagini, T.; Castellana, S.; Petrizzelli, F.; Capocefalo, D.; Jordan, F.; Carella, M.; Mazza, T. |