DI RIENZO, LORENZO
DI RIENZO, LORENZO
DIPARTIMENTO "ISTITUTO ITALIANO DI STUDI ORIENTALI - ISO"
2D Zernike polynomial expansion: finding the protein-protein binding regions
2021 Milanetti, E.; Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Monti, M.; Gosti, G.; Ruocco, G.
A computational approach to investigate tdp-43 rna-recognition motif 2 c-terminal fragments aggregation in amyotrophic lateral sclerosis
2021 Grassmann, G.; Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Salaris, F.; Silvestri, B.; Zacco, E.; Rosa, A.; Tartaglia, G. G.; Ruocco, G.; Milanetti, E.
A novel computational strategy for defining the minimal protein molecular surface representation
2022 Grassmann, Greta; Miotto, Mattia; Di Rienzo, Lorenzo; Gosti, Giorgio; Ruocco, Giancarlo; Milanetti, Edoardo
A novel strategy for molecular interfaces optimization: the case of ferritin-transferrin receptor interaction
2020 Di Rienzo, L.; Milanetti, E.; Testi, C.; Montemiglio, L. C.; Baiocco, P.; Boffi, A.; Ruocco, G.
Binding site identification of G protein-coupled receptors through a 3D Zernike polynomials-based method: application to C. elegans olfactory receptors
2022 Di Rienzo, L.; De Flaviis, L.; Ruocco, G.; Folli, V.; Milanetti, E.
Characterizing hydropathy of amino acid side chain in a protein environment by investigating the structural changes of water molecules network
2021 Di Rienzo, L.; Miotto, M.; Bo, L.; Ruocco, G.; Raimondo, D.; Milanetti, E.
Computational Approaches to Predict Protein–Protein Interactions in Crowded Cellular Environments
2024 Grassmann, Greta; Miotto, Mattia; Desantis, Fausta; Di Rienzo, Lorenzo; Tartaglia, Gian Gaetano; Pastore, Annalisa; Ruocco, Giancarlo; Monti, Michele; Milanetti, Edoardo
Computational evidences of a misfolding event in an aggregation‐prone light chain preceding the formation of the non‐native pathogenic dimer
2024 Desantis, Fausta; Miotto, Mattia; Milanetti, Edoardo; Ruocco, Giancarlo; DI RIENZO, Lorenzo
Computational optimization of angiotensin-converting enzyme 2 for SARS-CoV-2 Spike molecular recognition
2021 Di Rienzo, L.; Monti, M.; Milanetti, E.; Miotto, M.; Boffi, A.; Tartaglia, G. G.; Ruocco, G.
Design of protein-binding peptides with controlled binding affinity: the case of SARS-CoV-2 receptor binding domain and angiotensin-converting enzyme 2 derived peptides
2024 Parisi, G.; Piacentini, R.; Incocciati, A.; Bonamore, A.; Macone, A.; Rupert, J.; Zacco, E.; Miotto, M.; Milanetti, E.; Tartaglia, G. G.; Ruocco, G.; Boffi, A.; Di Rienzo, L.
Differences in the organization of interface residues tunes the stability of the sars-cov-2 spike-ace2 complex
2023 Miotto, Mattia; Di Rienzo, Lorenzo; Grassmann, Greta; Desantis, Fausta; Cidonio, Gianluca; Gosti, Giorgio; Leonetti, Marco; Ruocco, Giancarlo; Milanetti, Edoardo
Does blood type affect the COVID-19 infection pattern?
2021 Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Gosti, G.; Milanetti, E.; Ruocco, G.
Dynamical changes of SARS-CoV-2 spike variants in the highly immunogenic regions impact the viral antibodies escaping
2023 Di Rienzo, L.; Miotto, M.; Desantis, F.; Grassmann, G.; Ruocco, G.; Milanetti, E.
Electrostatic complementarity at the interface drives transient protein-protein interactions
2023 Grassmann, Greta; DI RIENZO, Lorenzo; Gosti, Giorgio; Leonetti, Marco; Ruocco, Giancarlo; Miotto, Mattia; Milanetti, Edoardo
Exploiting Reaction-Diffusion Conditions to Trigger Pathway Complexity in the Growth of a MOF
2021 Calvo Galve, N.; Abrishamkar, A.; Sorrenti, A.; Di Rienzo, L.; Satta, M.; D'Abramo, M.; Coronado, E.; de Mello, A. J.; Minguez Espallargas, G.; Puigmarti-Luis, J.
Exploring the Association Between Sialic Acid and SARS-CoV-2 Spike Protein Through a Molecular Dynamics-Based Approach
2021 Bò, Leonardo; Miotto, Mattia; Di Rienzo, Lorenzo; Milanetti, Edoardo; Ruocco, Giancarlo
In-Silico Evidence for a Two Receptor Based Strategy of SARS-CoV-2
2021 Milanetti, E.; Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Nagaraj, M.; Monti, M.; Golbek, T. W.; Gosti, G.; Roeters, S. J.; Weidner, T.; Otzen, D. E.; Ruocco, G.
Inferring the stabilization effects of SARS-CoV-2 variants on the binding with ACE2 receptor
2022 Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Gosti, G.; Bo', L.; Parisi, G.; Piacentini, R.; Boffi, A.; Ruocco, G.; Milanetti, E.
Insights into the interaction mechanism of DTP3 with MKK7 by using STD-NMR and computational approaches
2021 Sandomenico, Annamaria; Di Rienzo, Lorenzo; Calvanese, Luisa; Iaccarino, Emanuela; D'Auria, Gabriella; Falcigno, Lucia; Chambery, Angela; Russo, Rosita; Franzoso, Guido; Tornatore, Laura; D'Abramo, Marco; Ruvo, Menotti; Milanetti, Edoardo; Raimondo, Domenico
Insights on protein thermal stability: a graph representation of molecular interactions
2019 Miotto, Mattia; Olimpieri, PIER PAOLO; DI RIENZO, Lorenzo; Ambrosetti, Francesco; Corsi, Pietro; Lepore, Rosalba; Tartaglia, Gian Gaetano; Milanetti, Edoardo
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| 2D Zernike polynomial expansion: finding the protein-protein binding regions | 2021 | Milanetti, E.; Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Monti, M.; Gosti, G.; Ruocco, G. | |
| A computational approach to investigate tdp-43 rna-recognition motif 2 c-terminal fragments aggregation in amyotrophic lateral sclerosis | 2021 | Grassmann, G.; Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Salaris, F.; Silvestri, B.; Zacco, E.; Rosa, A.; Tartaglia, G. G.; Ruocco, G.; Milanetti, E. | |
| A novel computational strategy for defining the minimal protein molecular surface representation | 2022 | Grassmann, Greta; Miotto, Mattia; Di Rienzo, Lorenzo; Gosti, Giorgio; Ruocco, Giancarlo; Milanetti, Edoardo | |
| A novel strategy for molecular interfaces optimization: the case of ferritin-transferrin receptor interaction | 2020 | Di Rienzo, L.; Milanetti, E.; Testi, C.; Montemiglio, L. C.; Baiocco, P.; Boffi, A.; Ruocco, G. | |
| Binding site identification of G protein-coupled receptors through a 3D Zernike polynomials-based method: application to C. elegans olfactory receptors | 2022 | Di Rienzo, L.; De Flaviis, L.; Ruocco, G.; Folli, V.; Milanetti, E. | |
| Characterizing hydropathy of amino acid side chain in a protein environment by investigating the structural changes of water molecules network | 2021 | Di Rienzo, L.; Miotto, M.; Bo, L.; Ruocco, G.; Raimondo, D.; Milanetti, E. | |
| Computational Approaches to Predict Protein–Protein Interactions in Crowded Cellular Environments | 2024 | Grassmann, Greta; Miotto, Mattia; Desantis, Fausta; Di Rienzo, Lorenzo; Tartaglia, Gian Gaetano; Pastore, Annalisa; Ruocco, Giancarlo; Monti, Michele; Milanetti, Edoardo | |
| Computational evidences of a misfolding event in an aggregation‐prone light chain preceding the formation of the non‐native pathogenic dimer | 2024 | Desantis, Fausta; Miotto, Mattia; Milanetti, Edoardo; Ruocco, Giancarlo; DI RIENZO, Lorenzo | |
| Computational optimization of angiotensin-converting enzyme 2 for SARS-CoV-2 Spike molecular recognition | 2021 | Di Rienzo, L.; Monti, M.; Milanetti, E.; Miotto, M.; Boffi, A.; Tartaglia, G. G.; Ruocco, G. | |
| Design of protein-binding peptides with controlled binding affinity: the case of SARS-CoV-2 receptor binding domain and angiotensin-converting enzyme 2 derived peptides | 2024 | Parisi, G.; Piacentini, R.; Incocciati, A.; Bonamore, A.; Macone, A.; Rupert, J.; Zacco, E.; Miotto, M.; Milanetti, E.; Tartaglia, G. G.; Ruocco, G.; Boffi, A.; Di Rienzo, L. | |
| Differences in the organization of interface residues tunes the stability of the sars-cov-2 spike-ace2 complex | 2023 | Miotto, Mattia; Di Rienzo, Lorenzo; Grassmann, Greta; Desantis, Fausta; Cidonio, Gianluca; Gosti, Giorgio; Leonetti, Marco; Ruocco, Giancarlo; Milanetti, Edoardo | |
| Does blood type affect the COVID-19 infection pattern? | 2021 | Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Gosti, G.; Milanetti, E.; Ruocco, G. | |
| Dynamical changes of SARS-CoV-2 spike variants in the highly immunogenic regions impact the viral antibodies escaping | 2023 | Di Rienzo, L.; Miotto, M.; Desantis, F.; Grassmann, G.; Ruocco, G.; Milanetti, E. | |
| Electrostatic complementarity at the interface drives transient protein-protein interactions | 2023 | Grassmann, Greta; DI RIENZO, Lorenzo; Gosti, Giorgio; Leonetti, Marco; Ruocco, Giancarlo; Miotto, Mattia; Milanetti, Edoardo | |
| Exploiting Reaction-Diffusion Conditions to Trigger Pathway Complexity in the Growth of a MOF | 2021 | Calvo Galve, N.; Abrishamkar, A.; Sorrenti, A.; Di Rienzo, L.; Satta, M.; D'Abramo, M.; Coronado, E.; de Mello, A. J.; Minguez Espallargas, G.; Puigmarti-Luis, J. | |
| Exploring the Association Between Sialic Acid and SARS-CoV-2 Spike Protein Through a Molecular Dynamics-Based Approach | 2021 | Bò, Leonardo; Miotto, Mattia; Di Rienzo, Lorenzo; Milanetti, Edoardo; Ruocco, Giancarlo | |
| In-Silico Evidence for a Two Receptor Based Strategy of SARS-CoV-2 | 2021 | Milanetti, E.; Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Nagaraj, M.; Monti, M.; Golbek, T. W.; Gosti, G.; Roeters, S. J.; Weidner, T.; Otzen, D. E.; Ruocco, G. | |
| Inferring the stabilization effects of SARS-CoV-2 variants on the binding with ACE2 receptor | 2022 | Miotto, M.; Di Rienzo, L.; Gosti, G.; Bo', L.; Parisi, G.; Piacentini, R.; Boffi, A.; Ruocco, G.; Milanetti, E. | |
| Insights into the interaction mechanism of DTP3 with MKK7 by using STD-NMR and computational approaches | 2021 | Sandomenico, Annamaria; Di Rienzo, Lorenzo; Calvanese, Luisa; Iaccarino, Emanuela; D'Auria, Gabriella; Falcigno, Lucia; Chambery, Angela; Russo, Rosita; Franzoso, Guido; Tornatore, Laura; D'Abramo, Marco; Ruvo, Menotti; Milanetti, Edoardo; Raimondo, Domenico | |
| Insights on protein thermal stability: a graph representation of molecular interactions | 2019 | Miotto, Mattia; Olimpieri, PIER PAOLO; DI RIENZO, Lorenzo; Ambrosetti, Francesco; Corsi, Pietro; Lepore, Rosalba; Tartaglia, Gian Gaetano; Milanetti, Edoardo |