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Multifaceted enrichment analysis of RNA-RNA crosstalk reveals cooperating micro-societies in human colorectal cancer
2016 Mazza, Tommaso; Mazzoccoli, Gianluigi; Fusilli, Caterina; Capocefalo, Daniele; Panza, Anna; Biagini, Tommaso; Castellana, Stefano; Gentile, Annamaria; De Cata, Angelo; Palumbo, Orazio; Stallone, Raffaella; Rubino, Rosa; Carella, Massimo; Piepoli, Ada
Analysis of clock gene-miRNA correlation networks reveals candidate drivers in colorectal cancer
2016 Mazzoccoli, Gianluigi; Colangelo, Tommaso; Panza, Anna; Rubino, Rosa Anna; Tiberio, Cristiana; Palumbo, Orazio; Carella, Massimo; Trombetta, Domenico; Gentile, Annamaria; Tavano, Francesca; Valvano, Maria Rosa; Storlazzi, Clelia Tiziana; Macchia, Gemma; De Cata, Angelo; Bisceglia, Giovanni; Capocefalo, Daniele; Colantuoni, Vittorio; Sabatino, Lina; Piepoli, Ada; Mazza, Tommaso
High-confidence assessment of functional impact of human mitochondrial non-synonymous genome variations by APOGEE
2017 Castellana, Stefano; Fusilli, Caterina; Mazzoccoli, Gianluigi; Biagini, Tommaso; Capocefalo, Daniele; Carella, Massimo; Vescovi, Angelo Luigi; Mazza, Tommaso
MicroRNA co-expression networks exhibit increased complexity in pancreatic ductal compared to Vater’s papilla adenocarcinoma
2017 Mazza, Tommaso; Copetti, Massimiliano; Capocefalo, Daniele; Fusilli, Caterina; Biagini, Tommaso; Carella, Massimo; De Bonis, Antonio; Mastrodonato, Nicola; Piepoli, Ada; Pazienza, Valerio; Maiello, Evaristo; Francesco Di Mola, Fabio; Di Sebastiano, Pierluigi; Andriulli, Angelo; Tavano, Francesca
Molecular dynamics recipes for genome research
2017 Biagini, Tommaso; Chillemi, Giovanni; Mazzoccoli, Gianluigi; Grottesi, Alessandro; Fusilli, Caterina; Capocefalo, Daniele; Castellana, Stefano; Vescovi, Angelo Luigi; Mazza, Tommaso
Insights from Molecular Characterization of Adult Patients of Families with Multigenerational Diabetes Mellitus
2018 Pezzilli, Serena; Ludovico, Ornella; Biagini, Tommaso; Mercuri, Luana; Alberico, Federica; Lauricella, Eleonora; Dallali, Hamza; Capocefalo, Daniele; Carella, Massimo; Miccinilli, Elide; Piscitelli, Pamela; Scarale, Maria Giovanna; Mazza, Tommaso; Trischitta, Vincenzo; Prudente, Sabrina
Systematic analysis of mouse genome reveals distinct evolutionary and functional properties among circadian and ultradian genes
2018 Castellana, Stefano; Mazza, Tommaso; Capocefalo, Daniele; Genov, Nikolai; Biagini, Tommaso; Fusilli, Caterina; Scholkmann, Felix; Relógio, Angela; Hogenesch, John B.; Mazzoccoli, Gianluigi
Food web topology and nested keystone species complexes
2018 Capocefalo, Daniele; Pereira, Juliana; Mazza, Tommaso; Jordán, Ferenc
Are gaming-enabled graphic processing unit cards convenient for molecular dynamics simulation?
2019 Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Truglio, Mauro; Cespa, Roberto; Barbieri, Alessandro; Capocefalo, Daniele; Castellana, Stefano; Tevy, Maria Florencia; Carella, Massimo; Mazza, Tommaso
Reverse engineering of natural systems by graph theory
2019 Capocefalo, Daniele
Pyntacle: a parallel computing-enabled framework for large-scale network biology analysis
2020 Parca, L.; Truglio, M.; Biagini, T.; Castellana, S.; Petrizzelli, F.; Capocefalo, D.; Jordan, F.; Carella, M.; Mazza, T.
Curation of causal interactions mediated by genes associated with autism accelerates the understanding of gene-phenotype relationships underlying neurodevelopmental disorders
2023 Iannuccelli, Marta; Vitriolo, Alessandro; Licata, Luana; Lo Surdo, Prisca; Contino, Silvia; Cheroni, Cristina; Capocefalo, Daniele; Castagnoli, Luisa; Testa, Giuseppe; Cesareni, Gianni; Perfetto, Livia
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
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| Multifaceted enrichment analysis of RNA-RNA crosstalk reveals cooperating micro-societies in human colorectal cancer | 2016 | Mazza, Tommaso; Mazzoccoli, Gianluigi; Fusilli, Caterina; Capocefalo, Daniele; Panza, Anna; Biagini, Tommaso; Castellana, Stefano; Gentile, Annamaria; De Cata, Angelo; Palumbo, Orazio; Stallone, Raffaella; Rubino, Rosa; Carella, Massimo; Piepoli, Ada | |
| Analysis of clock gene-miRNA correlation networks reveals candidate drivers in colorectal cancer | 2016 | Mazzoccoli, Gianluigi; Colangelo, Tommaso; Panza, Anna; Rubino, Rosa Anna; Tiberio, Cristiana; Palumbo, Orazio; Carella, Massimo; Trombetta, Domenico; Gentile, Annamaria; Tavano, Francesca; Valvano, Maria Rosa; Storlazzi, Clelia Tiziana; Macchia, Gemma; De Cata, Angelo; Bisceglia, Giovanni; Capocefalo, Daniele; Colantuoni, Vittorio; Sabatino, Lina; Piepoli, Ada; Mazza, Tommaso | |
| High-confidence assessment of functional impact of human mitochondrial non-synonymous genome variations by APOGEE | 2017 | Castellana, Stefano; Fusilli, Caterina; Mazzoccoli, Gianluigi; Biagini, Tommaso; Capocefalo, Daniele; Carella, Massimo; Vescovi, Angelo Luigi; Mazza, Tommaso | |
| MicroRNA co-expression networks exhibit increased complexity in pancreatic ductal compared to Vater’s papilla adenocarcinoma | 2017 | Mazza, Tommaso; Copetti, Massimiliano; Capocefalo, Daniele; Fusilli, Caterina; Biagini, Tommaso; Carella, Massimo; De Bonis, Antonio; Mastrodonato, Nicola; Piepoli, Ada; Pazienza, Valerio; Maiello, Evaristo; Francesco Di Mola, Fabio; Di Sebastiano, Pierluigi; Andriulli, Angelo; Tavano, Francesca | |
| Molecular dynamics recipes for genome research | 2017 | Biagini, Tommaso; Chillemi, Giovanni; Mazzoccoli, Gianluigi; Grottesi, Alessandro; Fusilli, Caterina; Capocefalo, Daniele; Castellana, Stefano; Vescovi, Angelo Luigi; Mazza, Tommaso | |
| Insights from Molecular Characterization of Adult Patients of Families with Multigenerational Diabetes Mellitus | 2018 | Pezzilli, Serena; Ludovico, Ornella; Biagini, Tommaso; Mercuri, Luana; Alberico, Federica; Lauricella, Eleonora; Dallali, Hamza; Capocefalo, Daniele; Carella, Massimo; Miccinilli, Elide; Piscitelli, Pamela; Scarale, Maria Giovanna; Mazza, Tommaso; Trischitta, Vincenzo; Prudente, Sabrina | |
| Systematic analysis of mouse genome reveals distinct evolutionary and functional properties among circadian and ultradian genes | 2018 | Castellana, Stefano; Mazza, Tommaso; Capocefalo, Daniele; Genov, Nikolai; Biagini, Tommaso; Fusilli, Caterina; Scholkmann, Felix; Relógio, Angela; Hogenesch, John B.; Mazzoccoli, Gianluigi | |
| Food web topology and nested keystone species complexes | 2018 | Capocefalo, Daniele; Pereira, Juliana; Mazza, Tommaso; Jordán, Ferenc | |
| Are gaming-enabled graphic processing unit cards convenient for molecular dynamics simulation? | 2019 | Biagini, Tommaso; Petrizzelli, Francesco; Truglio, Mauro; Cespa, Roberto; Barbieri, Alessandro; Capocefalo, Daniele; Castellana, Stefano; Tevy, Maria Florencia; Carella, Massimo; Mazza, Tommaso | |
| Reverse engineering of natural systems by graph theory | 2019 | Capocefalo, Daniele | |
| Pyntacle: a parallel computing-enabled framework for large-scale network biology analysis | 2020 | Parca, L.; Truglio, M.; Biagini, T.; Castellana, S.; Petrizzelli, F.; Capocefalo, D.; Jordan, F.; Carella, M.; Mazza, T. | |
| Curation of causal interactions mediated by genes associated with autism accelerates the understanding of gene-phenotype relationships underlying neurodevelopmental disorders | 2023 | Iannuccelli, Marta; Vitriolo, Alessandro; Licata, Luana; Lo Surdo, Prisca; Contino, Silvia; Cheroni, Cristina; Capocefalo, Daniele; Castagnoli, Luisa; Testa, Giuseppe; Cesareni, Gianni; Perfetto, Livia |
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