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Early events in protein aggregation: Molecular flexibility and hydrophobicity/charge interaction in amyloid peptides as studied by molecular dynamics simulations 1-gen-2005 Valerio, Mariacristina; Colosimo, Alfredo; Conti, Filippo; Giuliani, Alessandro; Grottesi, Alessandro; Manetti, Cesare; Zbilut, Joseph P.
Modeling conformational transitions in kinases by molecular dynamics simulations: achievements, difficulties, and open challenges 1-gen-2014 D'Abramo, Marco; Besker, Neva; Chillemi, Giovanni; Grottesi, Alessandro
Effect of DNA on the conformational dynamics of the endonucleases I-DmoI as provided by molecular dynamics simulations 1-gen-2016 Grottesi, Alessandro; Cecconi, Simone; Molina, Rafael; D'Abramo, Marco
Molecular dynamics recipes for genome research 1-gen-2017 Biagini, Tommaso; Chillemi, Giovanni; Mazzoccoli, Gianluigi; Grottesi, Alessandro; Fusilli, Caterina; Capocefalo, Daniele; Castellana, Stefano; Vescovi, Angelo Luigi; Mazza, Tommaso
Custom scoring Aurora-A with SMINA 1-gen-2019 Esposito, Chiara; Grottesi, Alessandro; Janson, Giacomo; Paiardini, Alessandro
Revisiting the “satisfaction of spatial restraints” approach of MODELLER for protein homology modeling 1-gen-2019 Janson, G.; Grottesi, A.; Pietrosanto, M.; Ausiello, G.; Guarguaglini, G.; Paiardini, A.
Insights into pparγphosphorylation and its inhibition mechanism 1-gen-2020 Montanari, R.; Capelli, D.; Yamamoto, K.; Awaishima, H.; Nishikata, K.; Barendregt, A.; Heck, A. J. R.; Loiodice, F.; Altieri, F.; Paiardini, A.; Grottesi, A.; Pirone, L.; Pedone, E.; Peiretti, F.; Brunel, J. M.; Itoh, T.; Pochetti, G.
Phosphorylation, mg‐adp, and inhibitors differentially shape the conformational dynamics of the a‐loop of aurora‐a 1-gen-2021 Musavizadeh, Z.; Grottesi, A.; Guarguaglini, G.; Paiardini, A.
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