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Alternative splicing tends to avoid partial removals of protein-protein interaction sites
2013 Colantoni, Alessio; Bianchi, Valerio; Gherardini, Pier Federico; SCALIA TOMBA, Gianpaolo; Ausiello, Gabriele; Helmer Citterich, Manuela; Ferre', Fabrizio
DBATE: Database of alternative transcripts expression
2013 Bianchi, Valerio; Colantoni, Alessio; Calderone, Alberto; Ausiello, Gabriele; Ferre', Fabrizio; Helmer Citterich, Manuela
Revealing protein-lncRNA interaction
2016 Ferre', Fabrizio; Colantoni, Alessio; Helmer Citterich, Manuela
FUS affects circular RNA expression in murine embryonic stem cell-derived motor neurons
2017 Errichelli, Lorenzo; DINI MODIGLIANI, Stefano; Laneve, Pietro; Colantoni, Alessio; Legnini, Ivano; Capauto, Davide; Rosa, Alessandro; DE SANTIS, Riccardo; Scarfò, Rebecca; Peruzzi, Giovanna; Lu, Lei; Caffarelli, Elisa; Shneider, Neil A.; Morlando, Mariangela; Bozzoni, Irene
FUS mutant human motoneurons display altered transcriptome and microRNA pathways with implications for ALS pathogenesis
2017 DE SANTIS, Riccardo; Santini, Laura; Colantoni, Alessio; Peruzzi, Giovanna; DE TURRIS, Valeria; Alfano, Vincenzo; Bozzoni, Irene; Rosa, Alessandro
A Regulatory Circuitry Between Gria2, miR-409, and miR-495 Is Affected by ALS FUS Mutation in ESC-Derived Motor Neurons
2018 Capauto, Davide; Colantoni, Alessio; Lu, Lei; Santini, Tiziana; Peruzzi, Giovanna; Biscarini, Silvia; Morlando, Mariangela; Shneider, Neil A.; Caffarelli, Elisa; Laneve, Pietro; Bozzoni, Irene
Deficiency in the nuclear long noncoding RNACharme causes myogenic defects and heart remodeling in mice
2018 Ballarino, Monica; Cipriano, Andrea; Tita, Rossella; Santini, Tiziana; Desideri, Fabio; Morlando, Mariangela; Colantoni, Alessio; Carrieri, Claudia; Nicoletti, Carmine; Musarò, Antonio; Carroll, Dònal O’; Bozzoni, Irene
The Long Non-coding RNA lnc-31 Interacts with Rock1 mRNA and Mediates Its YB-1-Dependent Translation
2018 Dimartino, Dacia; Colantoni, Alessio; Ballarino, Monica; Martone, Julie; Mariani, Davide; Danner, Johannes; Bruckmann, Astrid; Meister, Gunter; Morlando, Mariangela; Bozzoni, Irene
Characterization of the lncRNA transcriptome in mESC-derived motor neurons: Implications for FUS-ALS
2018 Biscarini, Silvia; Capauto, Davide; Peruzzi, Giovanna; Lu, Lei; Colantoni, Alessio; Santini, Tiziana; Shneider, Neil A; Caffarelli, Elisa; Laneve, Pietro; Bozzoni, Irene
Deciphering the long noncoding RNAs language in myogenesis: a comprehensive glimpse on Charme
2019 Buonaiuto, Giulia; Desideri, Fabio; Taliani, Valeria; Santini, Tiziana; Colantoni, Alessio; Perlas, Emerald; Nicoletti, Carmine; Musaro', Antonio; Bozzoni, Irene; Ballarino, Monica
Circ-ZNF609 regulates G1-S progression in rhabdomyosarcoma
2019 Rossi, Francesca; Legnini, Ivano; Megiorni, Francesca; Colantoni, Alessio; Santini, Tiziana; Morlando, Mariangela; DI TIMOTEO, Gaia; Dattilo, Dario; Dominici, Carlo; Bozzoni, Irene
MicroRNAs from saliva of anopheline mosquitoes mimic human endogenous miRNAs and may contribute to vector-host-pathogen interactions
2019 Arcà, Bruno; Colantoni, Alessio; Fiorillo, Carmine; Severini, Francesco; Benes, Vladimir; Di Luca, Marco; Calogero, Raffaele A; Lombardo, Fabrizio
Mutant FUS and ELAVL4 (HuD) aberrant crosstalk in Amyotrophic Lateral Sclerosis
2019 De Santis, R.; Alfano, V.; de Turris, V.; Colantoni, A.; Santini, L.; Garone, M. G.; Antonacci, G.; Peruzzi, G.; Sudria-Lopez, E.; Wyler, E.; Anink, J. J.; Aronica, E.; Landthaler, M.; Pasterkamp, R. J.; Bozzoni, I.; Rosa, A.
Modulation of circRNA Metabolism by m6A modification
2020 Di Timoteo, G.; Dattilo, D.; Centron-Broco, A.; Colantoni, A.; Guarnacci, M.; Rossi, Francesca; Incarnato, D.; Oliviero, S.; Fatica, A.; Morlando, M.; Bozzoni, I.
Trans-generational epigenetic regulation associated with the amelioration of Duchenne Muscular Dystrophy
2020 Martone, J.; Lisi, M.; Castagnetti, F.; Rosa, A.; Di Carlo, V.; Blanco, E.; Setti, A.; Mariani, D.; Colantoni, A.; Santini, T.; Perone, L.; Di Croce, L.; Bozzoni, I.
Intronic determinants coordinate charme lncRNA nuclear activity through the interaction with MATR3 and PTBP1
2020 Desideri, F.; Cipriano, A.; Petrezselyova, S.; Buonaiuto, G.; Santini, T.; Kasparek, P.; Prochazka, J.; Janson, G.; Paiardini, A.; Calicchio, A.; Colantoni, A.; Sedlacek, R.; Bozzoni, I.; Ballarino, M.
Zooming in on protein–RNA interactions: a multilevel workflow to identify interaction partners
2020 Colantoni, A.; Rupert, J.; Vandelli, A.; Tartaglia, G. G.; Zacco, E.
SMaRT lncRNA controls translation of a G-quadruplex-containing mRNA antagonizing the DHX36 helicase
2020 Martone, J.; Mariani, D.; Santini, T.; Setti, A.; Shamloo, S.; Colantoni, A.; Capparelli, F.; Paiardini, A.; Dimartino, D.; Morlando, M.; Bozzoni, I.
Proteomics analysis of FUS mutant human motoneurons reveals altered regulation of cytoskeleton and other ALS-linked proteins via 3′UTR binding
2020 Garone, Maria Giovanna; Alfano, Vincenzo; Salvatori, Beatrice; Braccia, Clarissa; Peruzzi, Giovanna; Colantoni, Alessio; Bozzoni, Irene; Armirotti, Andrea; Rosa, Alessandro
A longitudinal study defined circulating microRNAs as reliable biomarkers for disease prognosis and progression in ALS human patients
2021 Dobrowolny, Gabriella; Martone, Julie; Lepore, Elisa; Casola, Irene; Petrucci, Antonio; Inghilleri, Maurizio; Morlando, Mariangela; Colantoni, Alessio; Scicchitano, Bianca Maria; Calvo, Andrea; Bisogni, Giulia; Chiò, Adriano; Sabatelli, Mario; Bozzoni, Irene; Musarò, Antonio
| Titolo | Data di pubblicazione | Autore(i) | File |
|---|---|---|---|
| Alternative splicing tends to avoid partial removals of protein-protein interaction sites | 2013 | Colantoni, Alessio; Bianchi, Valerio; Gherardini, Pier Federico; SCALIA TOMBA, Gianpaolo; Ausiello, Gabriele; Helmer Citterich, Manuela; Ferre', Fabrizio | |
| DBATE: Database of alternative transcripts expression | 2013 | Bianchi, Valerio; Colantoni, Alessio; Calderone, Alberto; Ausiello, Gabriele; Ferre', Fabrizio; Helmer Citterich, Manuela | |
| Revealing protein-lncRNA interaction | 2016 | Ferre', Fabrizio; Colantoni, Alessio; Helmer Citterich, Manuela | |
| FUS affects circular RNA expression in murine embryonic stem cell-derived motor neurons | 2017 | Errichelli, Lorenzo; DINI MODIGLIANI, Stefano; Laneve, Pietro; Colantoni, Alessio; Legnini, Ivano; Capauto, Davide; Rosa, Alessandro; DE SANTIS, Riccardo; Scarfò, Rebecca; Peruzzi, Giovanna; Lu, Lei; Caffarelli, Elisa; Shneider, Neil A.; Morlando, Mariangela; Bozzoni, Irene | |
| FUS mutant human motoneurons display altered transcriptome and microRNA pathways with implications for ALS pathogenesis | 2017 | DE SANTIS, Riccardo; Santini, Laura; Colantoni, Alessio; Peruzzi, Giovanna; DE TURRIS, Valeria; Alfano, Vincenzo; Bozzoni, Irene; Rosa, Alessandro | |
| A Regulatory Circuitry Between Gria2, miR-409, and miR-495 Is Affected by ALS FUS Mutation in ESC-Derived Motor Neurons | 2018 | Capauto, Davide; Colantoni, Alessio; Lu, Lei; Santini, Tiziana; Peruzzi, Giovanna; Biscarini, Silvia; Morlando, Mariangela; Shneider, Neil A.; Caffarelli, Elisa; Laneve, Pietro; Bozzoni, Irene | |
| Deficiency in the nuclear long noncoding RNACharme causes myogenic defects and heart remodeling in mice | 2018 | Ballarino, Monica; Cipriano, Andrea; Tita, Rossella; Santini, Tiziana; Desideri, Fabio; Morlando, Mariangela; Colantoni, Alessio; Carrieri, Claudia; Nicoletti, Carmine; Musarò, Antonio; Carroll, Dònal O’; Bozzoni, Irene | |
| The Long Non-coding RNA lnc-31 Interacts with Rock1 mRNA and Mediates Its YB-1-Dependent Translation | 2018 | Dimartino, Dacia; Colantoni, Alessio; Ballarino, Monica; Martone, Julie; Mariani, Davide; Danner, Johannes; Bruckmann, Astrid; Meister, Gunter; Morlando, Mariangela; Bozzoni, Irene | |
| Characterization of the lncRNA transcriptome in mESC-derived motor neurons: Implications for FUS-ALS | 2018 | Biscarini, Silvia; Capauto, Davide; Peruzzi, Giovanna; Lu, Lei; Colantoni, Alessio; Santini, Tiziana; Shneider, Neil A; Caffarelli, Elisa; Laneve, Pietro; Bozzoni, Irene | |
| Deciphering the long noncoding RNAs language in myogenesis: a comprehensive glimpse on Charme | 2019 | Buonaiuto, Giulia; Desideri, Fabio; Taliani, Valeria; Santini, Tiziana; Colantoni, Alessio; Perlas, Emerald; Nicoletti, Carmine; Musaro', Antonio; Bozzoni, Irene; Ballarino, Monica | |
| Circ-ZNF609 regulates G1-S progression in rhabdomyosarcoma | 2019 | Rossi, Francesca; Legnini, Ivano; Megiorni, Francesca; Colantoni, Alessio; Santini, Tiziana; Morlando, Mariangela; DI TIMOTEO, Gaia; Dattilo, Dario; Dominici, Carlo; Bozzoni, Irene | |
| MicroRNAs from saliva of anopheline mosquitoes mimic human endogenous miRNAs and may contribute to vector-host-pathogen interactions | 2019 | Arcà, Bruno; Colantoni, Alessio; Fiorillo, Carmine; Severini, Francesco; Benes, Vladimir; Di Luca, Marco; Calogero, Raffaele A; Lombardo, Fabrizio | |
| Mutant FUS and ELAVL4 (HuD) aberrant crosstalk in Amyotrophic Lateral Sclerosis | 2019 | De Santis, R.; Alfano, V.; de Turris, V.; Colantoni, A.; Santini, L.; Garone, M. G.; Antonacci, G.; Peruzzi, G.; Sudria-Lopez, E.; Wyler, E.; Anink, J. J.; Aronica, E.; Landthaler, M.; Pasterkamp, R. J.; Bozzoni, I.; Rosa, A. | |
| Modulation of circRNA Metabolism by m6A modification | 2020 | Di Timoteo, G.; Dattilo, D.; Centron-Broco, A.; Colantoni, A.; Guarnacci, M.; Rossi, Francesca; Incarnato, D.; Oliviero, S.; Fatica, A.; Morlando, M.; Bozzoni, I. | |
| Trans-generational epigenetic regulation associated with the amelioration of Duchenne Muscular Dystrophy | 2020 | Martone, J.; Lisi, M.; Castagnetti, F.; Rosa, A.; Di Carlo, V.; Blanco, E.; Setti, A.; Mariani, D.; Colantoni, A.; Santini, T.; Perone, L.; Di Croce, L.; Bozzoni, I. | |
| Intronic determinants coordinate charme lncRNA nuclear activity through the interaction with MATR3 and PTBP1 | 2020 | Desideri, F.; Cipriano, A.; Petrezselyova, S.; Buonaiuto, G.; Santini, T.; Kasparek, P.; Prochazka, J.; Janson, G.; Paiardini, A.; Calicchio, A.; Colantoni, A.; Sedlacek, R.; Bozzoni, I.; Ballarino, M. | |
| Zooming in on protein–RNA interactions: a multilevel workflow to identify interaction partners | 2020 | Colantoni, A.; Rupert, J.; Vandelli, A.; Tartaglia, G. G.; Zacco, E. | |
| SMaRT lncRNA controls translation of a G-quadruplex-containing mRNA antagonizing the DHX36 helicase | 2020 | Martone, J.; Mariani, D.; Santini, T.; Setti, A.; Shamloo, S.; Colantoni, A.; Capparelli, F.; Paiardini, A.; Dimartino, D.; Morlando, M.; Bozzoni, I. | |
| Proteomics analysis of FUS mutant human motoneurons reveals altered regulation of cytoskeleton and other ALS-linked proteins via 3′UTR binding | 2020 | Garone, Maria Giovanna; Alfano, Vincenzo; Salvatori, Beatrice; Braccia, Clarissa; Peruzzi, Giovanna; Colantoni, Alessio; Bozzoni, Irene; Armirotti, Andrea; Rosa, Alessandro | |
| A longitudinal study defined circulating microRNAs as reliable biomarkers for disease prognosis and progression in ALS human patients | 2021 | Dobrowolny, Gabriella; Martone, Julie; Lepore, Elisa; Casola, Irene; Petrucci, Antonio; Inghilleri, Maurizio; Morlando, Mariangela; Colantoni, Alessio; Scicchitano, Bianca Maria; Calvo, Andrea; Bisogni, Giulia; Chiò, Adriano; Sabatelli, Mario; Bozzoni, Irene; Musarò, Antonio |
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